Dícese del carácter que se diferencia de manera cualitativa del que determina el otro alelo; por ejemplo, el carácter de «flor blanca», en oposición al de «flor amarilla»; este concepto se opone al de carácter cuantitativo, cuya manifestación, que puede ser gradual, se determina por cierto tipo de unidad. En general, el carácter cuantitativo se rige por gen polímero; el carácter cualitativo, por lo regular, tiene una base genética más sencilla.