Fue profesor de botánica en la «Hohen Carlsschule de Stuttgart», y uno de los maestros del naturalista francés Georges Cuvier (1769-1832). El trabajo de Kerner era bien conocido tanto Charles Darwin y Alfred Russel Wallace, quien se refiere a él en sus escritos. Fue conocido sobre todo como un destacado experto en la flora alpina, además, que hizo importantes trabajos experimentales en un entorno alpino cuando se transporta un número de especies cultivadas en Viena a altas altitudes cercanas a examinar los cambios que puedan tener lugar, y si estos cambios resultaría hereditariamente transmisibles. Este erudito describió tres variedades de Salix, dos especies de geranios, y la strelitzia. Estudió y dio su nombre científico a Raphanus sativus var. niger (Mill.) (J.Kern.).