Virus de la familia Flaviviridae que infecta a numerosos vertebrados e invertebrados; son patógenos del hombre y animales. Existe sólo un género Flavivirus, al cual pertenece como especie tipo el virus de la fiebre amarilla. En ciertas clasificaciones, los flavivirus se incluyen dentro de la familia de los togavirus, Togaviridae, como un género más de los que contiene esta familia. El flavivirus de la fiebre amarilla es uno de los más pequeños, de unos 45 nm de diámetro, y con una nucleocápsida de 35 nanómetros. Es muy inestable y por calentamiento o por desinfectantes comunes se puede inactivar de forma sencilla. Es un virus neurotropo (se localiza en el sistema nervioso central) y viscerotropo (tiende a situarse en víceras como hígado, riñón y corazón). En general, los flavivirus contienen ácido ribonucleico (ARN) monocatenario en su genoma y presentan envoltura.